(1)審核目的不同。內審從改善內部管理的角度出發(fā)，通過(guò)對發(fā)現的問(wèn)題采取相應糾正、預防措施，推動(dòng)質(zhì)量改進(jìn)；外審是通過(guò)對實(shí)驗室的質(zhì)量管理體系進(jìn)行合格評定，確定實(shí)驗室具備相應的能力，從而為實(shí)驗室提供認證或其他服務(wù)。

　　(2)審核組的組成不同。內審以實(shí)驗室自己的名義組成審核組，由實(shí)驗室最高管理者聘任有資格的人員和有關(guān)人員實(shí)施；外審是第三方認可機構或客戶(hù)委派審核組，實(shí)驗室認可由經(jīng)認可機構考核確認的有資格的人員實(shí)施。

　　(3)審核計劃不同。內審可編制年度滾動(dòng)計劃，每月審核一個(gè)或幾個(gè)要素，半年或一年覆蓋全部要素或部門(mén)；外審是短期內審核所有有關(guān)部門(mén)和要素的現場(chǎng)評審計劃。

　　(4)樣本量和審核深度不同。內審時(shí)間充裕，抽取樣本量大，審核較深。外審時(shí)間短，抽取樣本量和深度相對較小。

　　(5)不符合項分類(lèi)不同。內審的不符合項按性質(zhì)分類(lèi)，可分為體系性不符合、實(shí)施性不符合、效果性不符合。外審的不符合項按嚴重程度分類(lèi)，分為基本符合但有缺陷、不符合。

　　(6)審核員對糾正措施的處置不同。內審對糾正措施不作具體咨詢(xún)，但可提方向性意見(jiàn)供參考，內審員對完成情況需跟蹤和驗證。外審對糾正措施不能作咨詢(xún)，對整改計劃的落實(shí)要經(jīng)審核組長(cháng)認可，若為不符合項，還可派人到實(shí)驗室復查。