日前,中國計量科學(xué)研究院(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“中國計量院”)聯(lián)合北京科興中維生物技術(shù)有限公司成功研制了新冠病毒奧密克戎變異株基因組RNA標準物質(zhì)。項目組以新冠病毒奧密克戎變異株為候選物,對其滅活后進(jìn)行基因組RNA純化、序列表征和量值測定。該標準物質(zhì)可用于驗證現有核酸檢測試劑盒是否會(huì )對奧密克戎變異株漏檢,以及新冠病毒檢測分型試劑盒的開(kāi)發(fā)。
此次開(kāi)發(fā)的標準物質(zhì)涵蓋新冠病毒奧密克戎變異株的全部序列,高通量測序和數字PCR結果表明不存在其他病毒和新冠變異序列。采用經(jīng)國際比對驗證的數字PCR方法,對開(kāi)放閱讀框(ORF1ab)基因、核衣殼蛋白N基因、包膜蛋白E基因和刺突蛋白S基因進(jìn)行了準確定值。特性量值為每管溶液中含有的新冠病毒奧密克戎變異株的ORF1ab、N、E和S基因的拷貝數濃度。具體量值見(jiàn)表1。
編號 |
名稱(chēng) |
基因 |
標準值 (×103 copies/μL) |
擴展不確定度(k=2) (×103 copies/μL) |
NIM-RM5225 |
新型冠狀病毒奧密克戎變異株基因組RNA標準物質(zhì) |
Orf1ab |
1.26 |
0.25 |
E |
2.61 |
0.46 |
||
N |
5.62 |
0.69 |
||
S |
1.89 |
0.23 |
表1. 新冠病毒奧密克戎變異株基因組RNA標準物質(zhì)特性量值
新冠病毒奧密克戎變異株基因組RNA標準物質(zhì)S基因的序列中單核苷酸變異位點(diǎn)包括A67V、T95I、Y145D等30多個(gè)變異位點(diǎn),主要變異位點(diǎn)見(jiàn)圖1。
圖1. 新冠病毒奧密克戎變異株基因組RNA標準物質(zhì)S基因變異位點(diǎn)
據了解,此次為中國計量院繼德?tīng)査―elta,B.1.617.2)、阿爾法(Alpha,B.1.1.7)、貝塔(Beta,B.1.351)、伽馬(Gamma,P.1)變異株等標準物質(zhì)之后的又一突破。
截至2022年1月底,中國計量院已成功研制了核酸、抗原和抗體等30種新冠病毒相關(guān)的標準物質(zhì),該系列標準物質(zhì)可應用于方法建立、方法驗證、質(zhì)量控制、試劑性能評估、驗證與評價(jià)等多方面。上述標準物質(zhì)已廣泛應用于全國31個(gè)省市的700余家單位,為保障新冠病毒檢測結果準確、可比、可溯源提供了技術(shù)支撐。(文/圖:董蓮華)
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